На основе современных представлений о структурной и функциональной организации иммунных процессов с позиций системного подхода обосновывается концепция антигенно-структурного гомеостаза. Описаны подсистемы, звенья, связи, уровни регуляции и управления в иммунной системе. Рассматриваются проблемы эволюции иммунной системы, определяемой становлением и развитием механизмов сохранения генетически детерминированной индивидуальности структур организмов. Основное внимание при конкретизации выдвинутых положений уделено анализу собственных и литературных данных о регуляции созревания и дифференцировки иммунокомпетентных клеток, природе антигенноcти и иммуногенности, о взаимодействии лимфоцитов в гуморальном иммунном ответе. Представлена математическая модель авторегуляции иммунного ответа. Обсуждаются механизмы нарушения иммунной регуляции при аутоиммунных заболеваниях животных и человека. Намечаются некоторые принципы комплексного подхода к оценке состояния иммунной системы при аутоиммунном процессе. Приводятся данные о дестабилизации функций иммунной системы и роли межсистемных, лимфоэндокринных взаимодействий при адаптации человека к экстремальным факторам среды.