Рассматриваются методологические вопросы психофизиологии функциональных состояний, включая роль и место ФС в деятельности и его зависимость от индивидуальных различий, возможности использования для диагностики ФС вегетативных показателей, главным образом сердечно-сосудистых, электроэнцефалографических и биохимических. Анализируется роль медиаторных и пептидергических механизмов в регуляции ФС, биохимическое обеспечение агрессии, страха, отклонений состояний при депрессии, шизофрении. Рассматриваются результаты психофизиологической диагностики ФС на практике, методы, которые рекомендуются для выявления неблагоприятных состояний и выделения групп риска, возможности предсказания развития неоптимальных состояний на основе индивидуальных различий. Предлагаются новые методы диагностики состояния с помощью построения пространств по частотным спектрам ритрограммы сердечного ритма и ЭЭГ.